男主不断穿越时空，进入各个平行世界，见到了各个版本的蝙蝠侠、超人、超女……

影片开始，“闪电侠The Flash”巴里·艾伦Barry Allen（埃兹拉·米勒Ezra Miller 饰演）和正义联盟的“蝙蝠侠Batman”布鲁斯·韦恩Bruce Wayne（本·阿弗莱克Ben Affleck 饰）、“神奇女侠Wonder Woman”戴安娜·普林斯Diana Prince（盖尔·加朵Gal Gadot 饰）、“海王Aquaman”亚瑟·库瑞Arthur Curry（杰森·莫玛Jason Momoa 饰演）保护着世界，但巴里一直忙于家事。闪电侠巴里·艾伦超越光速跑动，需要进食大量热量食物；巴里买食物时，蝙蝠侠的老管家阿尔弗雷德·潘尼沃斯Alfred Pennyworth（杰瑞米·艾恩斯Jeremy Irons 饰演）让他去帮忙，其他超英都有事情……

这天早上，巴里Barry在快餐店购买早餐，从电视新闻了解到哥谭市发生银行劫案；于是，他赶紧从戒指里拿出战衣穿上，超高速跑到高谭市帮忙……

此时，蝙蝠侠在开摩托追捕银行劫匪，劫匪头目是黑帮家族法尔康尼的小儿子阿尔·法尔科内Al Falcone（卢克·布兰登·菲尔德Luke Brandon Field 饰演）……劫匪从医院抢劫剧毒药品，并炸开一条路……大楼即将坍塌，巴里负责救人，凭借自己超光速的跑动，救了医生、护士（Florence Wright 饰演）和病人，还救了很多婴儿……

追击中，蝙蝠侠即将坠落桥底之时，神奇女侠戴安娜·普林斯利用真言套索将蝙蝠侠救起，而闪电侠也在此时赶到现场。不过，由于碰到真言套索，蝙蝠侠彷佛吃了诚实果子，滔滔不绝说出藏在心底的真心话，例如我有偶包、家庭创伤等等……巴里·艾伦也爆出惊人言论：我是处男！……三人抓获银行劫匪……

之后，巴里超高速跑回，买了早餐，跑到公司上班，发现还是迟到了，被印度裔上司大卫·辛格David Singh（桑吉夫·巴哈斯卡Sanjeev Bhaskar 饰演）说了几句……

随后，影片闪回，2013年，巴里调查母亲的谋杀案时，被闪电击中、药水溅满全身，其后就获得了超能力……在大都会的战役中，巴里和布鲁斯一同帮助疏散平民……偶然间，闪电侠Barry发现只要跑得比光速快，就能让时光倒流……

此时，巴里的父亲亨利·艾伦Henry Allen（朗·里维斯顿Ron Livingston 饰演）因为涉嫌杀妻，在坐牢……巴里试图帮助父亲亨利出狱，但并没有成功。布鲁斯在法院门口接巴里回家，巴里偷走了记者（安德斯·穆斯切蒂Andy Muschietti 饰演）的热狗……回到家，巴里就想穿越时空回到小时候，阻止悲剧事件发生，让母亲复活；蝙蝠侠告诉他，那很危险，但巴里不听奉劝……

原来，2001年，巴里（Ian Loh 饰演）的母亲诺拉·艾伦Nora Allen（玛丽贝尔·瓦度Maribel Verdú 饰演）让丈夫亨利·艾伦出去买西红柿酱，巴里听到屋中有动静，就出来看，发现母亲倒在血泊之中，父亲亨利抱着母亲……巴里跑出追凶手，一个黄色战衣一闪消失（黄衣凶手是“逆闪电Reverse-Flash”艾尔伯德·斯旺Eobard Thawne）……由于无辜的亨利当时去买东西时，摄像头没有拍到他的脸，而无法证明他的清白，因此涉嫌杀妻而坐牢……

接着，巴里从黑人女友艾瑞丝·维斯特Iris West（科雷西·克莱门斯Kiersey Clemons 饰演）处想到方法，利用时空之碗、超光速快跑，成功穿越时空回到2001年……

在2001年，巴里在超市偷了一罐番茄酱，迫使他母亲诺拉去另一家商店购买；因此，谋杀案发生时，她母亲并不在家。

拯救母亲后，巴里打算超光速快跑、跑回2023年；但在公路上高速快跑、穿越至2013年时，“黑暗闪电侠Dark Flash”（埃兹拉·米勒Ezra Miller 饰演）袭击了他，他跌倒地上，最终他掉落在了2013年。

在2013年，巴里回到家，发现自己的母亲诺拉还活着，还看到了父亲亨利；父母还惊奇问巴里的发型怎么变成平头短发的了？此时，巴里看到窗外长发的18岁自己Teenage Barry（埃兹拉·米勒Ezra Miller 饰演）正往家走，那个时期的巴里还在上大学。大巴里为了不让父母发觉，赶紧偷跑出去，一把扑倒小巴里，小巴里惊恐看着面前短发的另一个自己……

大巴里对小巴里讲述平行世界，又想起当天6月16日的日期是自己获得超能力的日期；于是，大巴里带小巴里来到实验室，接受闪电电击；闪电击中药瓶后，小巴里惧怕而反抗，导致二人同时被电击，大巴里牙掉了一颗，就用胶水粘上。这时，大巴里发现自己没有了超能力，而小巴里有了超能力。

小巴里刚有超能力，很是兴奋，在公路上超高速快跑，衣服都因空气摩擦而起火，结果制造了火灾混乱……于是，大巴里就教小巴里如何避免在超高速中衣服因空气摩擦而起火，还教他如何使用戒指里的战衣……

接着，电视上出现氪星的将军德鲁-佐德Zod（迈克尔·珊农Michael Shannon 饰演）和其副官菲奥拉Faora-Ul（安婕·特拉乌Antje Traue 饰演）驾驶飞船在找超人……大巴里在小巴里家里，结识小巴里的几个神经质室友阿尔伯特·德斯蒙德Albert（鲁迪·曼卡索Rudy Mancuso 饰演）、帕蒂·斯皮沃特Patty（希尔莎-莫妮卡·杰克逊Saoirse-Monica Jackson 饰演）……

而后，大巴里开始找其他正义联盟成员，结果发现超级英雄都没有，钢骨根本不存在，戴安娜公主是剧场演员，而海王的父亲托马斯·库瑞Thomas Curry（特穆拉·莫里森Temuera Morrison 饰演）根本就没遇到亚特兰蒂斯女王，他有妻子（Rosie Ede 饰演），所以海王压根就没出生……大、小巴里又谈起《回到未来》这部电影，发现二人说的男主角演员根本不是一个人，大巴里意识到时间线不对……

大、小巴里来到蝙蝠侠布鲁斯·韦恩家，大巴里发现蝙蝠侠布鲁斯·韦恩Bruce Wayne（迈克尔·基顿Michael Keaton 饰）年迈颓废，不是自己印象里的蝙蝠侠（本·阿弗莱克Ben Affleck 饰）。蝙蝠侠用意面解释，称这是巴里制造了时空混乱造成的，改变过去会产生无数时间线，而且会有节点……大巴里意识到他在改变过去时不小心将不同的时间线纠缠在了一起，需要修复时间线。

在洞穴里，蝙蝠侠打开设备搜寻超人，发现超人被俄罗斯雇佣兵抓获；大巴里决定去俄罗斯救出被囚禁的超人，小巴里却说那是苏联；虽然基顿蝠很不情愿，但最终同意帮忙并再次穿上战衣……

接着，三人乘蝙蝠战机驶往苏联……来到西伯利亚的一个军事基地上空，三人穿蝙蝠衣跳伞，一轮圆月中映出蝙蝠状……三人闯入基地营救超人，结果，他们发现找到的并不是超人，而是一个奄奄一息的女人；大巴里救了女人，发现这个女人是“超级少女Supergirl”卡拉·佐-艾尔Kara Zor-El（萨莎·卡莱Sasha Calle 饰演）。卡拉称自己是克拉克的堂姐，负责保护堂弟克拉克；在孩提时，因救生舱掉落地球而被俘，她被囚禁了一辈子……卡拉经过日光浴，恢复了超能力；对基地的俄雇佣兵上尉（Alex Batareanu 饰演）、俄雇佣兵（Andrei Nova 饰演）、首席科学家（Gabriel Constantin 饰演）、科学家（Oleg Mirochnikov、Katia Elizarova、Dennis Good 饰演）就是一顿爆锤……完事，卡拉说自己不是人类、人类不值得救。说完，卡拉就抛弃了大、小巴里和蝙蝠侠，飞走了……但很快，卡拉又回来拯救他们……

他们把卡拉带回了韦恩庄园，大巴里对她产生了好感……基顿蝠试图通过电击来恢复大巴里的超能力，但是失败了。而卡拉将大巴里扔进风暴里，他被雷电击中后，终于恢复了超能力。

与此同时，佐德将军开始在沙漠改造地球，2个闪电侠、蝙蝠侠和超女前来阻止他，引发了大规模的战斗……打斗中，卡拉得知克拉克在婴儿时就被佐德杀死了，很是愤怒……

几人去对抗佐德将军，卡拉被杀；布鲁斯战机的弹射椅出故障，不得不撞机也死了……两个巴里几次穿越时空回到之前，尝试救卡拉、布鲁斯，但全部失败，卡拉、布鲁斯依旧被杀……小巴里意识到这是新时间线的一个固定点，无法被改变。但大巴里无法接受卡拉的死亡并继续尝试，直到他自己消失在了神速力中……

小巴里再次穿越时空时，在时空隧道发现一人，此人就是一直在隧道中出不去的黑暗闪电侠Dark Flash……小巴里意识到这个黑暗闪电侠其实是大巴里的未来版本，黑暗闪电侠开始埋怨小巴里改变过去的做法。黑闪Dark Flash说自己花了无数的时间穿越时空，尝试了无数的可能性结果都没有成功，由于反复与佐德作战，他的身体里嵌满了弹片，伤得很重，并且他开始相信只有杀死小巴里才能拯救世界。

小巴里意识到自己犯下大错后，试图跑回过去撤销他所做的一切；但是，黑闪紧随其后，开始追杀他，因为他认为巴里太过危险不适合生存。黑闪最终追上了小巴里，就在他要杀死小巴里时，大巴里从他的时间线早些时候返回，老巴里·艾伦跳到两人中间，被黑闪捅了一刀，用牺牲自己的生命拯救了小巴里。由于大巴里与黑闪是同一个人，大巴里死去，黑闪就消失了……

闪电侠回到了2001年，在穿梭的过程中，他看到了不同的时间线，包括乔治·里弗斯George Reeves版的超人、克里斯托弗·里夫Christopher Reeve版的超人、海伦·斯雷特Helen Slater版的女超人、亚当·韦斯特Adam West版的蝙蝠侠、琳达·卡特版的神奇女侠、尼古拉斯·凯奇Nicolas Cage版的超人、乔治·克鲁尼George Clooney版的蝙蝠侠和泰迪·西尔斯版的极速教授。（1998年，提姆波顿Tim Burton拍摄的《Superman Lives》遭到腰斩，但如今，在本片中终于可以在屏幕上看见尼可拉斯·凯奇大战巨型蜘蛛的片段……）

在2001年，巴里回到童年时的超市，母亲诺拉并不认识他；巴里把番茄酱罐子放回货架，最后一次和最爱的母亲对话；母亲诺拉一如既往的善良，主动拥抱眼前这个陌生却悲伤的男孩；两人有一个非常温馨的时刻，因为他知道母亲之后会死。离开时，巴里把父亲亨利买的番茄酱放到货架最上层，这样父亲就会抬头去取，摄像头就会记录下他的脸……

翌日，法庭重审案件，听证会上，巴里的父亲亨利让黑人律师（Karl Collins 饰演）拿出了证据，女法官（Lynn Farleigh 饰演）在超市监控中看到了亨利的脸，——由于巴里把西红柿酱放在了货架的最上面，所以亨利抬头才能拿到……这段监控视频证明了亨利没有做案时间、当时不在凶杀现场，因此他被当庭无罪释放……

修复了时间线后，巴里超光速快跑，穿越时空回到现在，却发现自己又来到了一个完全不同的宇宙，——在那里，闪电侠打电话给蝙蝠侠；当蝙蝠侠开车来到下车时，出现的蝙蝠侠版本来自《蝙蝠侠与罗宾》的蝙蝠侠（乔治·克鲁尼George Clooney 饰演）。当闪电侠大喊他不是真正的蝙蝠侠时，乔治·克鲁尼很沮丧......